Венцислав Мутафчийски е български военен лекар, професор от Военномедицинска академия (ВМА), генерал-майор от Военномедицинската служба, началник на ВМА, главен лекар на въоръжените сили на България и ръководител на Националния оперативен щаб за борба с коронавируса в България.
Роден е на 20 август 1964 г. в Дупница. През 1990 г. завършва медицина в Медицинския университет в София. От 1989 г. е офицер в Българската армия. През 1996 г. завършва „Обща хирургия“. Между 1997 и 2002 г. е асистент в Клиниката по съдова хирургия на ВМА. От 2000 до 2003 г. е старши асистент в Клиниката по обща хирургия. От 2003 до 2008 г. е главен асистент в Клиниката по жлъчно-чернодробна и панкреатична хирургия на ВМА.
През 2005 г. специализира „Военна хирургия“ и същата година става докторант. Защитава дисертация на тема „Взривна травма – обща характеристика, диагностичен и лечебен алгоритъм“ през 2011 г. От 2012 г. е доцент в професионално направление Медицина във ВМА. През 2014 г. става началник на катедрата по хирургия във ВМА и защитава дисертация на тема „Съвременна концепция за отворения корем“ за научната степен доктор на медицинските науки. Същата година става заместник-началник на академията. От 2015 г. е професор по хирургия.
От 2017 г. е временно изпълняващ длъжността началник на ВМА. На 7 февруари 2018 г. с указ на президента на България и със заповед на министъра на отбраната е назначен за началник на ВМА и главен лекар на въоръжените сили на България.
Удостоен е с висше офицерско звание генерал-майор, считано от 6 май 2019 г. На 24 февруари 2020 г. е назначен за ръководител на Националния оперативен щаб за борба с коронавируса в България.
Венцислав Мутафчийски е семеен, има двама синове.
